在動物醫院的門診上，小動物的下泌尿道疾病是相當常見的，但是往往因為背後原因的不同而有不同的預後。此外，犬與貓的病因亦有所不同，因此需要仔細分辨才能夠做到較好的治療。最常見的為下泌尿道感染症與貓自發性膀胱炎。
下泌尿道感染症
犬的下泌尿道疾病較為常見的病因爲泌尿道感染。雌性犬比起雄性犬更容易出現有下泌尿道感染。貓的下泌尿道疾病常見的病因多為自發性，而感染性的病因較少出現。年長貓則比起年輕貓較容易出現下泌尿道感染的情況。
泌尿道感染的致病機轉：
引起泌尿道感染的必要因素包括有：
- 有大量的泌尿道致病菌存在：最常見的致病原為大腸桿菌（E. coli）
- 下泌尿道上皮有與致病原接合
- 病患的泌尿道防禦失去正常的功能：包括了下泌尿道的結構異常與排尿習慣異常。
除了上述之外，在免疫狀況低下的時候，亦有增加下泌尿道感染的機會，包括了糖尿病、使用類固醇類藥物、貓甲狀腺功能亢進症、慢性腎病或使用化療藥物等。
下泌尿道感染症的診斷：
- 尿液檢查：
通常最重要的診斷是依據尿液檢查與尿液培養，尿液培養切勿使用自然排出尿液，應要以膀胱穿刺術為佳。獲取的尿液進行尿渣檢查時可能會發現有細菌存在與白血球反應；pH值可能會呈現鹼性（如果感染的病原菌會產生尿素酶的話）。另外，應該注意的是，當尿渣檢查沒有看到細菌時，並不表示無細菌感染（偽陰性），應該要以尿液培養為主，並且在培養陽性時，應該要進行藥物敏感性試驗。
- 影像學檢查：包括超音波與放射線學檢查。通常第一次發現泌尿道感染時，不見得必要進行影響檢查。
影像學檢查可以用來診斷是否有結石、評估膀胱與前列腺的狀態。施行Ｘ光造影檢查則有助於發現生理結構異常的問題。
下泌尿道感染症的治療：
- 在沒有其他生理結構異常、免疫地下的情況下，使用藥物治療通常會有良好的效果。尿液中的抗菌藥物濃度是最重要的重點。選擇有效、能夠充分分佈於下泌尿道的抗菌藥物是最重要的事。藥物治療的時間依照不同的病況應該至少要以14-30天，若是併有上泌尿道感染的情況，則可能需要至60天的治療期。最常見或最常使用的藥物包括：penicillins類、fluoroquinolones類。另外，應該要注意，年幼動物不應該使用fluoroquinolones類藥物。
- 支持治療：包括飲食與水分。目前並沒有足夠的證據證明透過飲食能夠避免感染的發生。水分則是應該盡可能地補充充足，增加病患的排尿機會。可以透過罐頭食物來增加水分的攝取量。
- 在反覆發生下泌尿道感染或非單一因素的下泌尿道感染症治療，則應該要考量淺在因素或疾病，包括化療、免疫抑制藥物、糖尿病、甲狀腺功能亢進症、腫瘤、生理結構等問題，並且盡可能地排除該因素。
- 下泌尿道治療成功的條件為治療過程與停藥之後都是能夠呈現尿液培養結果為無菌，方能稱為治療成功。通常在停藥之後的一週、四周與三個月後，進行尿液培養，並且結果應皆為陰性。
- 如果發生治療失敗的情況，則應該重新考量是否有未發現的潛在因素存在。
貓自發性膀胱炎
與犬相當不同的是，貓的下泌尿道感染是相當少見的，尤其是年輕貓。相反的，貓較常見的自發性膀胱炎，或又稱為間質性膀胱炎（此為引用人類醫學的名詞）。
貓自發性膀胱炎的致病機轉：
- 目前尚未清楚自發性膀胱炎的致病機制，其包含的因素相當廣泛，包括膀胱、神經系統、內分泌系統等。
- 有些貓在罹患急性自發性膀胱炎時，在沒有藥物治療之下仍可在一週左右就會自行緩解（有自限性）。
- 有些貓則會有反覆無常的發生自發性膀胱炎，可能異常的部分包括了膀胱上皮的損傷、膀胱的Glycosaminoglycan層（GSG層）分泌異常、交感神經作用異常、腎上腺皮質功能對緊迫的反應異常。
貓自發性膀胱炎的診斷：
自發性膀胱炎的診斷是透過排除其他因素包括：感染、結石、腫瘤等因素後，在無明確病因後，而確立為自發性膀胱炎。因此，診斷工具是屬於排除性質。
- 病史：良好的病史調查是對於診斷自發性膀胱炎來說，是重要的工具，透過詳細的病史調查，能夠知道貓是否存在可能的緊迫因素，這些因素包括了環境改變、家庭成員改變、環境設置是否過於單純、貓砂盆清潔度不佳等。
- 尿液檢查：通常自發性膀胱炎的尿液檢查結果並不具有足夠的敏感度與特異性，進行尿檢是為了排除其他可能病因，例如感染。通常尿液檢查會發現有血尿或是潛血反應。
- 影像學檢查：亦是用來排除其他可能性病因。
貓自發性膀胱炎的治療：
雖然貓自發性膀胱炎具有自限性，但是在某些會反覆發生或是有明顯臨床症狀的病患，應該積極進行治療與管理。
- 進行臨床症狀的管理，例如使用嗎啡類藥物進行止痛、提供膀胱解痙攣藥物等。
- 使用三環類抗憂鬱劑為可能的藥物選項，而非必要選項。在重度、高度反覆發生的病貓上可以考慮使用，可能能夠減少臨床症狀。使用此類藥物應注意的是“不可突然停藥”，會有突然反彈、加劇症狀的情況出現。
- 管理外在環境影響因素，包括改善不良的飼養環境、增加貓砂盆清潔頻率、減少環境緊迫因素等。
- 有部分較為緊張的貓咪，可能較容易出現緊迫性因素或者容易有腎上腺反應異常的情況，雖然無法直接改變這些屬於動物本身的內在因素，但是仍然可以試著設法一些能夠舒緩情緒的用品或是補充劑，例如貓用的費洛蒙、色氨酸、GSG層補充品等。
- 增加水份的攝取
- 環境多模式的改變，增加環境的豐富度，讓貓有躲藏、執行狩獵遊戲，能夠有助於減少反覆發生的可能性。